Achtest Du auch darauf, daß die jeweilige cfg-Datei nicht schreibgeschützt ist?
In dieser wird nämlich diese Divider-Einstellung gespeichert (oder eben nicht bei 'readonly').
Nötig war dieser Schreibschutz bei den Magnetsensorgeräten, damit beim Start die Ausgangsstellung nicht immer wieder erst aufgebaut werden muß.

Also: evt. Schreibschutz aufheben, Divider in der Emu deaktivieren (hab ich aber eigentlich für alle Geräte ja standardmäßig getan soweit ich mich erinnere!?), Emu beenden und Schreibschutz wieder aktivieren.
Wenn das auch nichts hilft, dann stimmt wirklich mit den neueren MAME/MESS-Versionen irgendwas nicht.