Erfahrung mit permanent-filzschreibern auf holzschachbrettern habe ich ZUM GLÜCK nicht.
Ich würde es aber mit einem saugfähigen lappen versuchen, der GUT mit spiritus getränkt ist.
Der spiritus greift das holzbrett nicht an, und durch ausreichend lösungsmittel wird gewährleistet, dass der farbstoff nicht flächig verwischt wird, sondern im lappen landet.
Das klappt am besten, wenn ein trockener lappen zum abwischen bereit liegt.